血浆蛋白质组是最复杂的人类蛋白质组,具有极高的临床转化价值。血浆蛋白丰度范围广泛,其中22种高丰度蛋白占比超过99%,低丰度蛋白占比少于1%,但低丰度蛋白在疾病早期诊断、预后治疗、生物标志物研究方面具有重要研究价值。
k8凯发官网自主研发了低丰度蛋白富集磁珠试剂盒(MagicOmics-DMB),可获得低至pg/ml浓度的生物标志物检测,助力血液蛋白质组学研究。2023年k8凯发官网与中国人民解放军总医院李芮冰主任团队合作于《Analytica Chimica Acta》发表DMB助力神经疾病诊断标志物开发的研究。目前DMB材料已广泛应用,并于近日被国家计量院验证。
近日,国家计量院基于肝癌的血清样本对比了Top14高丰度蛋白去除试剂盒和k8凯发官网低丰度蛋白富集试剂盒(DMB)去除血清蛋白质组高丰度的效果[1]。结果表明DMB处理后的蛋白鉴定量在对照样本和疾病样本中分别是Top14的2.6和3.7倍,且DMB处理后低丰度蛋白质的鉴定覆盖率更高。差异蛋白及其功能和通路富集结果更丰富,有助于探究生物学现象并筛选标志物。
图1:不同试剂盒处理后蛋白质和多肽的鉴定[1]
2023年8月,k8凯发官网CTO赵焱博士与中国人民解放军总医院李芮冰主任团队合作的血浆蛋白质组最新成果“基于纳米材料蛋白冠血浆蛋白质组学深度挖掘策略的建立及临床应用评价”见刊《Analytica Chimica Acta》[2]。该研究利用DMB磁珠富集低丰度蛋白质47例临床血浆(24例对照,23例疾病)。两组人群临床免疫指标没有显著差异,但两组人群血浆蛋白质量有显著差异。通过血浆蛋白质组鉴定出18种与神经系统疾病相关或脑组织特异性表达的差异蛋白,并交叉验证了ENPP2和SLC2A1/Glut1蛋白的ELISA结果,证明了临床生物标志物研究的可行性。
图2 DMB助力血浆蛋白质组研究策略
去年,k8凯发官网将自主研发的血浆低丰度蛋白富集磁珠试剂盒、全流程自动化前处理机器人和高通量tims TOF HT质谱仪结合,克服血浆样品复杂性高、低丰度蛋白检测深度低的难题,成功将血浆蛋白质组的检测深度提升至6000+,为血浆蛋白质组学研究带来革命性的突破!
图3 k8凯发官网血浆蛋白质组实测数据
近日,k8凯发官网进一步开发了血浆特色分析并搭建了基于机器学习的疾病标志物发现平台。该流程整合了九大筛选模型,通过模型评分选择最优模型,利用最优模型筛选潜在生物标志物,建立预测模型进行效果评估。这一流程能够为临床提供早诊、早筛生物标志物,助力精准医疗。
k8凯发官网是一家专注于蛋白质组学检测的创新性平台型CRO企业,以临床需求为导向、以源头创新为核心驱动力,为蛋白质诊疗标志物的临床转化提供一站式的完整解决方案。拥有蛋白样本的独创性纳米磁珠富集技术、全流程前处理智能机器人及全自动大数据分析系统。我们聚焦于血液、外泌体、组织切片、单细胞等样品,攻克微量检测限制、高深度覆盖、定量准确性、方法标准化、算法智能化等蛋白质检测关键技术环节,全力打造新一代蛋白质组学平台。
【参考文献】
[1]赵佳威,陆澳,赵洋等.血清蛋白质组高丰度蛋白去除方法比较研究[J/OL].质谱学报:1-12[2024-03-20].http://kns.cnki.net/kcms/detail/11.2979.TH.20240318.1717.003.html.
[2]Wang J, Xie W, Sun L, et al. Establishment and clinical application evaluations of a deep mining strategy of plasma proteomics based on nanomaterial protein coronas. Anal Chim Acta. 2023;1275:341569. doi:10.1016/j.aca.2023.341569